게임 창 활성화 방식에 따라 마우스 이벤트가 달라지나요?

창 모드 게임을 마우스로 클릭하면 다른 창의 버튼이나 화면이 먹통처럼 반응하지 않아요.
그런데 프로그램 함수로 클릭하거나 오른쪽 클릭을 하면 게임 창을 활성화한 상태에서도 바깥 화면이 정상적으로 작동하는 것처럼 보입니다.
타이머로 이런 상태를 유지할 수 있는지 궁금해요. GetDC나 GetActiveWindow, GetForegroundWindow를 확인해 봤지만 차이를 찾지 못했습니다.
스크린샷을 보여주는 프로그램도 게임을 왼쪽 클릭하면 화면이 멈추고, 클릭할 때마다 갱신돼요. 버튼을 누르고 있으면 실시간으로 보이고 오른쪽 클릭도 비슷합니다.
마우스로 직접 클릭하는 것과 VB 함수로 클릭하는 것은 어떤 차이가 있나요?
게임 창을 클릭했을 때 외부 화면이 멈추는 이유와 이를 해결할 API가 있는지도 알고 싶습니다.